|
姚登举学位: 博士 毕业院校: 哈尔滨工程大学 邮件: ydkvictory@hrbust.edu.cn 办公地点: 哈尔滨理工大学(西区)新主楼E1613室 电话: 出生年月: 1980-01-01 学科: 计算机科学与技术 |
相关教师 |
个人简历姚登举,工学博士,生物学博士后,教授,博士生导师;担任计算机科学与技术学院副院长、生物信息计算与数字健康学科方向带头人,黑龙江省计算机软件与理论领军人才梯队后备带头人,校学术委员会委员;是中国计算机学会(CCF)杰出会员、CCF生物信息学专委会执行委员、CCF生物信息学“新未来”青年学者研讨会(BIO-3NEW)执行委员,中国自动化学会(CAA)会员、CAA智能健康与生物信息专业委员会委员,中国生物工程学会会员、中国生物工程学会计算与生物信息专业委员会委员,国际计算生物学学会中国理事会(ISCB-China)理事,黑龙江省生物信息学学会会员、理事,黑龙江省计算机学会计算机应用专业委员会委员、智慧医疗专业委员会委员,全国计算生物学与生物信息学学术会议(NCCBB)程序委员、国家自然科学基金项目评审专家、Briefings in Bioinformatics、Scientific Reports等期刊审稿专家、iMeta期刊青年编委。主要从事机器学习和生物信息计算研究,聚焦人类复杂疾病相关的生物分子标志物识别、多组学数据融合分析、单细胞基因调控网络推断等研究方向,主持和参与国家自然科学基金面上项目、科技部外国专家项目、黑龙江省自然科学基金面上项目等纵向科研项目10余项,主持和参与省级以上教育教学研究项目7项,以第一或通讯作者发表SCI论文30余篇。 教育经历2010-09至2016-03, 哈尔滨工程大学, 计算机应用技术, 博士 2004-09至2007-04, 哈尔滨理工大学, 计算机应用技术, 硕士 2000-09至2004-07, 哈尔滨理工大学, 计算机科学与技术, 学士 工作经历2021-09至今, 哈尔滨理工大学, 计算机科学与技术学院, 教授 2019-03至2020-03, 南洋理工大学, 计算机科学与工程学院, 访问学者 2016-10至2019-08, 哈尔滨医科大学, 生物信息科学与技术学院,博士后 2014-09至2020-12, 哈尔滨理工大学, 软件与微电子学院, 副教授 2009-09至2014-08, 哈尔滨理工大学, 软件学院, 讲师 2007-04至2009-08, 哈尔滨理工大学, 软件学院, 助教 研究方向机器学习,人工智能,生物信息计算,包括但不限于集成学习,深度学习,联邦学习,特征选择,多组学数据融合分析、单细胞基因调控网络推断等。 承担项目1. 国家自然科学基金面上项目,基于多源生物数据融合的代谢综合征相关的lncRNA识别方法研究(主持,2022-2025) 2. 黑龙江省自然科学基金项目,基于多模态融合的环状RNA-疾病关联预测方法研究(主持,2024-2027) 3. 国家外国专家项目,人类复杂疾病相关的非编码RNA识别方法研究(主持,2022-2024) 4. 黑龙江省博士后科研启动金,基于多源生物数据融合与机器学习的lncRNA-disease关联预测算法研究(主持,2020-2022) 5. 哈尔滨市科技局青年后备人才项目,2型糖尿病风险生物标记识别及分子机制研究(主持,2017-2020) 6. 黑龙江省自然科学基金项目,面向高维小样本和类别不平衡数据分析的随机森林分类算法研究(主持,2014-2016) 7. 黑龙江省教育厅科学技术研究项目,基于随机森林的特征选择与分类技术研究(主持,2014-2016) 8. 哈尔滨市科技局青年后备人才项目,基于SIP的视频会议系统的研究与设计(主持,2011-2013) 9. 国家自然科学基金(应急管理),用于活体肝移植术前评估的肝脏CT图像自动分割方法研究(排名第二,2018-2018) 10. 哈尔滨市科技局青年后备人才项目,基于随机森林的数据分析软件设计(排名第二,2013-2015) 教学工作担任软件工程系系主任,主讲《操作系统》、《程序设计基础》等课程,主持省教研项目《基于OBE理念和“36550”的操作系统一流课程建设的研究与实践》和校教研项目5项,参与国家级、省级教研项目5项,发表教研论文10余篇;先后获得黑龙江省第二届高校(本科院校)微课教学比赛大赛理工组一等奖、第三届全国高等学校教师教学创新大赛黑龙江赛区三等奖、哈尔滨理工大学课程思政优秀案例等;多次被评为校优秀主讲教师、校优秀毕业设计指导教师、校“三全育人”先进个人。 招生信息每年招收计算机科学与技术(081200)专业博士研究生1人; 每年招收计算机科学与技术(081200)、软件工程(083500)、计算机技术(085404)、软件工程(085405)专业硕士研究生4人。 专利成果授权实用新型专利5项,软件著作权1项。 出版著作1. C语言程序设计实用教程,清华大学出版社,2012 2. 计算机专业英语,北京大学出版社,2012 3. Java程序设计与工程实践,清华大学出版社,2013 4. 软件架构设计实践——基于SSM框架, 电子工业出版社, 2024 发表论文1. Yao Dengju, et al. PDGAGRN: Graph diffusion pretraining and dynamic graph learning for gene regulatory network inference from single-cell RNA-sequencing data. Expert Systems with Applications, 2026. 2. Yao Dengju, et al. LLM4PDA: Augmenting piRNA-Disease Association Prediction with Large Language Models. Interdisciplinary Sciences: Computational Life Sciences, 2026. 3. Yao Dengju, et al. Prediction of lncRNA-disease associations based on multi-source topological information aggregation and BERT-inspired implicit feature completion. Journal of Computational Science, 2026. 4. Yao Dengju, et al. CaHoT-GRN: context-aware high-order topology learning for robust single-cell gene regulatory network inference. Briefings in Bioinformatics, 2026. 5. Yao Dengju, et al. MAGIC: A Multimodal Adaptive GRN Inference Constructor. Journal of Chemical Information and Modeling, 2025. 6. Yao Dengju, et al. DSGCNLDA: A Multi-view Learning Model with DualScope Attention for lncRNA-Disease Association Prediction. Interdisciplinary Sciences: Computational Life Sciences, 2025. 7. Yao Dengju, et al. MambaCAttnGCN+: a comprehensive framework integrating MambaTextCNN, cross-attention and graph convolution network for piRNA-disease association prediction. Scientific Reports, 2025. 8. Yao Dengju, et al. ncRNA2MetS v2.0: a manually curated database for metabolic syndrome-associated ncRNAs. Frontiers of Computer Science, 2025. 9. Yao Dengju, et al. Predicting lncRNA-disease associations using multiple metapaths in hierarchical graph attention networks. BMC Bioinformatics, 2024. 10. Yao Dengju, et al. Applying negative sample denoising and multi-view feature for lncRNA-disease association prediction. Frontiers in Genetics, 2024. 荣誉称号多次被评为校优秀主讲教师、校三全育人先进个人、校优秀共产党员、校优秀党务工作者、黑龙江省高校优秀共产党员等。 |