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姚登举

学位: 博士

毕业院校: 哈尔滨工程大学

邮件: ydkvictory@hrbust.edu.cn

办公地点: 哈尔滨理工大学(西区)新主楼E1513室

电话:

出生年月: 1980-01-01

学科: 计算机科学与技术

相关教师

个人简历

姚登举,工学博士,生物学博士后,教授,博士生导师;担任计算机科学与技术学院软件工程系主任,生物信息计算与数字健康学科方向带头人,校学术委员会委员,校教学指导委员会委员;是中国计算机学会高级会员、中国生物工程学会会员、黑龙江省生物信息学学会会员、中国计算机学会生物信息学专委会执行委员、中国生物工程学会计算与生物信息专业委员会委员、黑龙江省计算机学会计算机应用专业委员会委员、黑龙江省计算机学会智慧医疗专业委员会委员、黑龙江省生物信息学学会理事、第九届全国计算生物学与生物信息学学术会议(NCCBB)程序委员、国家自然科学基金项目评审专家、Briefings in Bioinformatics、Scientific Reports等期刊审稿专家、iMeta期刊青年编委。主要从事机器学习和生物信息计算研究,聚焦人类复杂疾病相关的分子标志物尤其是非编码RNA预测算法等研究方向,主持国家自然科学基金面上项目、科技部外国专家项目、黑龙江省自然科学基金面上项目等纵向科研项目7项,主持和参与省级以上教育教学研究项目6项,以第一作者或通讯作者发表学术论文30余篇,其中SCI检索10余篇。

教育经历

2010-09至2016-03, 哈尔滨工程大学, 计算机应用技术, 博士

2004-09至2007-04, 哈尔滨理工大学, 计算机应用技术, 硕士

2000-09至2004-07, 哈尔滨理工大学, 计算机科学与技术, 学士

工作经历

2021-09至今, 哈尔滨理工大学, 计算机科学与技术学院, 教授

2019-03至2020-03, 南洋理工大学, 计算机科学与工程学院, 访问学者

2016-10至2019-08, 哈尔滨医科大学, 生物信息科学与技术学院,博士后

2014-09至2020-12, 哈尔滨理工大学, 软件与微电子学院, 副教授

2009-09至2014-08, 哈尔滨理工大学, 软件学院, 讲师

2007-04至2009-08, 哈尔滨理工大学, 软件学院, 助教

研究方向

机器学习,数据挖掘,生物信息计算,包括但不限于集成学习,深度学习,联邦学习,特征选择,多源数据整合,生物医学大数据分析与应用等。

承担项目

1. 国家自然科学基金(面上),基于多源生物数据融合的代谢综合征相关的lncRNA识别方法研究(主持,2022-2025

2. 国家外国专家项目,人类复杂疾病相关的非编码RNA识别方法研究(主持,2022-2024)

3. 黑龙江省博士后科研启动金,基于多源生物数据融合与机器学习的lncRNA-disease关联预测算法研究(主持,2020-2022)

4. 哈尔滨市科技局青年后备人才项目,2型糖尿病风险生物标记识别及分子机制研究(主持,2017-2020)

5. 黑龙江省自然科学基金(面上),面向高维小样本和类别不平衡数据分析的随机森林分类算法研究(主持,2014-2016)

6. 黑龙江省教育厅科学技术研究项目(面上),基于随机森林的特征选择与分类技术研究(主持,2014-2016)

7. 哈尔滨市科技局青年后备人才项目,基于SIP的视频会议系统的研究与设计(主持,2011-2013)

8. 黑龙江省教育厅“理工英才”杰出青年项目,基于树模型与图谱模型的肝脏CT计算机辅助定位与分割技术(排名第二,2019-2021)

9. 国家自然科学基金(应急管理),用于活体肝移植术前评估的肝脏CT图像自动分割方法研究(排名第二,2018-2018)

10. 哈尔滨市科技局青年后备人才项目,基于随机森林的数据分析软件设计(排名第二,2013-2015)

教学工作

担任软件工程系系主任,主讲《操作系统》、《程序设计基础》等课程,主持省教研项目《基于OBE理念和“36550”的操作系统一流课程建设的研究与实践》和校教研项目5项,参与国家级、省级教研项目5项,发表教研论文10余篇;先后获得黑龙江省第二届高校(本科院校)微课教学比赛大赛理工组一等奖、第三届全国高等学校教师教学创新大赛黑龙江赛区三等奖、哈尔滨理工大学课程思政优秀案例等;多次被评为校优秀主讲教师、校优秀毕业设计指导教师、校“三全育人”先进个人。

招生信息

每年招收计算机科学与技术(081200)专业博士研究生1人;

每年招收计算机科学与技术(081200)、软件工程(083500)、计算机技术(085404)、软件工程(085405)专业硕士研究生4人。

专利成果

授权实用新型专利5项,软件著作权1项。

出版著作

1. C语言程序设计实用教程,清华大学出版社,2012

2. 计算机专业英语,北京大学出版社,2012

3. Java程序设计与工程实践,清华大学出版社,2013

发表论文

1. Yao Dengju*, Zhang Tao, Zhan Xiaojuan, Zhang Shuli, Zhan Xiaorong, Zhang Chao. Geometric complement heterogeneous information and random forest for predicting lncRNA-disease associations.Frontiers in Genetics, 2022, 13: 995532.

2. Wei Zheng, Yao Dengju*, Zhan Xiaojuan, Zhang Shuli. A clustering-based sampling method for miRNA-disease association prediction. Frontiers in Genetics, 2022, 13: 995535.

3. Sun Lijie, Lu Jixuan, Yao Dengju, Li Xinyu, Cao Yan, Gao Jie, Liu Jiangwen, Zheng Tiansheng, Wang Huiui, Zhan Xiaorong. Effect of DHCR7 for the co-occurrence of hypercholesterolemia and vitamin D deficiency in type 2 diabetes: Perspective of health prevention. Prev Med., 2023, 173:107576.

4. Dengju Yao*, Xiaojuan Zhan, Xiaorong Zhan, Chee Keong Kwoh, Peng Li, Jinke Wang. A random forest based computational model for predicting novel lncRNA-disease associations. BMC Bioinformatics, 2020, 21(1): 126

5. Dengju Yao*, Xiaojuan Zhan, Xiaorong Zhan, Chee Keong Kwoh, Peng Li, Jinke Wang. A random forest based computational model for predicting novel lncRNA-disease associations. BMC Bioinformatics, 2020, 21(1): 126

6. Dengju Yao*, Xiaojuan Zhan, Chee Keong Kwoh. An improved random forest based computational model for predicting novel miRNA-disease associations. BMC Bioinformatics, 2019, 20(1): 624

7. Dengju Yao#, Zijing Lin#, Xiaojuan Zhan, Xiaorong Zhan*. Identifying potential functional lncRNAs in metabolic syndrome by constructing a lncRNA-miRNA-mRNA network. Journal of Human Genetics, 2020, 65(11): 927-938

8. Dengju Yao*, Xiaojuan Zhan, Xiaorong Zhan, Chee Keong Kwoh, Yuezhongyi Sun. ncRNA2MetS: a manually curated database for non-coding RNAs associated with metabolic syndrome. PeerJ, 2019, 7: e7909

9. Jie Gao, Xinyu Li, You Wang, Yan Cao, Dengju Yao, Lijie Sun, Lv Qin, Hui Qiu, Xiaorong Zhan*. Adipocyte‐derived extracellular vesicles modulate appetite and weight through mTOR signalling in the hypothalamus. Acta Physiologica, 2019, 228(2): e13339

10. Dengju Yao*, Jing Yang, Xiaojuan Zhan, Xiaorong Zhan, Zhiqiang Xie. A novel random forests-based feature selection method for microarray expression data analysis. International Journal of Data Mining and Bioinformatics, 2015, 13(1): 84-101

11. Yao Dengju*, Yang Jing, Zhan Xiaojuan. A Novel Method for Disease Diagnosis: Hybrid of Random Forest and Multivariate Adaptive Regression Splines. Journal of Computers. 2013, 8(1): 170-177 

12. Yao Dengju*, Yang Jing, Zhan Xiaojuan. An Improved Random Forest Algorithm for Class-Imbalanced Data Classification and its Application in PAD Risk Factors Analysis. Open Electrical & Electronic Engineering Journal. 2013, 7: 62-70

荣誉称号

多次被评为校优秀主讲教师、校三全育人先进个人、校优秀共产党员、校优秀党务工作者、黑龙江省高校优秀共产党员等。